Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHE23Q8NDY6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE23Q8NDY6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms