Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCD7Q8N8D1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms