Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C17orf53Q8N3J3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf53Q8N3J3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
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