Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS3Q8IXF0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPAS3Q8IXF0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS3Q8IXF0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms