Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg4dQ8BGV9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg4dQ8BGV9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms