Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot1Q6ZQ08 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms