Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx4Q6RUU0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ptx4Q6RUU0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptx4Q6RUU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms