Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggnbp1Q6K1E7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms