Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ScapQ6GQT6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ScapQ6GQT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ScapQ6GQT6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms