Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd1Q61345 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd1Q61345 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd1Q61345 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms