Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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Mkrn3Q60764 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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Mkrn3Q60764 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mkrn3Q60764 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms