Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF38BQ5VTL8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms