Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Psme4Q5SSW2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme4Q5SSW2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms