Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim58Q5NCC9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim58Q5NCC9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms