Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C2cd3Q52KB6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C2cd3Q52KB6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2cd3Q52KB6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2cd3Q52KB6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2cd3Q52KB6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C2cd3Q52KB6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C2cd3Q52KB6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2cd3Q52KB6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms