Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Carmil2Q3V3V9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Carmil2Q3V3V9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms