Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C87499Q3UX49 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C87499Q3UX49 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms