Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm10Q3UTQ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm10Q3UTQ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.7 ms