Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT24Q2M2I5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms