Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX3Q13761 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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