Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL4AQ13619 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4AQ13619 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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