Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pate4Q09098 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate4Q09098 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms