Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MestQ07646 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MestQ07646 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MestQ07646 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MestQ07646 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MestQ07646 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MestQ07646 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MestQ07646 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MestQ07646 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MestQ07646 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MestQ07646 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MestQ07646 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MestQ07646 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MestQ07646 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MestQ07646 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MestQ07646 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MestQ07646 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MestQ07646 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MestQ07646 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MestQ07646 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MestQ07646 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MestQ07646 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MestQ07646 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MestQ07646 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MestQ07646 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms