Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sdr16c6Q05A13 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sdr16c6Q05A13 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms