Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r236Q05A06 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms