Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha4Q03137 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms