Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APBA1Q02410 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms