Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCEQ02156 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCEQ02156 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms