Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoa1Q00623 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms