Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psme1P97371 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psme1P97371 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Psme1P97371 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psme1P97371 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Psme1P97371 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psme1P97371 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psme1P97371 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Psme1P97371 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Psme1P97371 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme1P97371 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Psme1P97371 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Psme1P97371 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme1P97371 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme1P97371 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme1P97371 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme1P97371 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psme1P97371 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme1P97371 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms