Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kifap3P70188 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kifap3P70188 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kifap3P70188 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.2 ms