Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl31P62900 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl31P62900 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms