Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4A3P38919 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4A3P38919 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4A3P38919 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms