Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upk2P38575 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms