Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGM1P36871 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM1P36871 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM1P36871 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM1P36871 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM1P36871 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM1P36871 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM1P36871 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM1P36871 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM1P36871 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM1P36871 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM1P36871 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM1P36871 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM1P36871 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM1P36871 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM1P36871 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM1P36871 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms