Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MgpP19788 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MgpP19788 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MgpP19788 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MgpP19788 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MgpP19788 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MgpP19788 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MgpP19788 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MgpP19788 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MgpP19788 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MgpP19788 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms