Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpraP18052 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtpraP18052 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpraP18052 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpraP18052 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpraP18052 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpraP18052 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpraP18052 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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