Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00271P0C7V0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00271P0C7V0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms