Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2aP08775 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2aP08775 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2aP08775 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2aP08775 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2aP08775 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2aP08775 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2aP08775 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2aP08775 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2aP08775 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms