Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf3P05524 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms