Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaskO70589 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaskO70589 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaskO70589 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaskO70589 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaskO70589 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaskO70589 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaskO70589 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaskO70589 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaskO70589 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaskO70589 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaskO70589 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaskO70589 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaskO70589 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CaskO70589 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CaskO70589 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaskO70589 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaskO70589 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaskO70589 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaskO70589 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CaskO70589 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CaskO70589 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CaskO70589 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CaskO70589 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CaskO70589 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CaskO70589 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CaskO70589 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CaskO70589 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms