Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC11O43248 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC11O43248 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms