Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac1O09106 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac1O09106 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac1O09106 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms