Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem200cJ3QK46 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms