Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17728E9Q5K2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17728E9Q5K2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms