Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prrt2E9PUL5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrt2E9PUL5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrt2E9PUL5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms