Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms