Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930444P10RikD3YUR1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930444P10RikD3YUR1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930444P10RikD3YUR1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930444P10RikD3YUR1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930444P10RikD3YUR1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930444P10RikD3YUR1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930444P10RikD3YUR1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930444P10RikD3YUR1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms