Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp42B2RQC2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms