Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H60bB1B212 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H60bB1B212 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H60bB1B212 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H60bB1B212 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms